三代平台的PacBio Sequel的平均读长为8-12Kb,16S rDNA长度大约为1500bp左右,该平台可以成功测序获得16S/18S/ITS的全长序列,获得全部变异区域序列信息,不仅能提高物种鉴定的分辨率,还能提高样本中微生物组成鉴定的精确度,从而能更加真实的还原样本中微生物的群落结构。
PacBio SMRT测序的长读长可以减少部分拼接错误,有效提高微生物群落鉴定的分辨率。
分析优势
高通量--能同时分析群落中所有的微生物;
高数据质量--采用PacBio的CCS模式,对序列自我矫正,数据一致性准确率高;
高分辨率--分析16 S rDNA全长,分类精准到种。
技术路线
技术参数