泛基因组是指通过对同一物种不同品种基因组进行测序、组装，一方面比较不同品种基因组之间的结构变异，挖掘品种特异的存在-缺失突变，了解物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征；另一方面构建core genome（核心基因组）和dispensable genome（非核心基因组），进而解析品种特异的生物学属性。
进行泛基因组分析，可选择不同亚种材料进行泛基因组测序来研究物种的起源及演化等重要生物学问题；也可选择野生种和栽培种等不同特性的种质资源进行泛基因组测序去发掘重要性状相关的基因资源，为科学育种提供指导；还可选择不同生态地理类型的种质资源进行泛基因组测序开展物种的适应性进化，外来物种入侵性等热门科学问题的研究，为分子生态学等学科提供新的研究手段。
泛基因组的发展历程
应用方向：
技术路线：
泛基因组分析技术路线
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