基因组De novo,又称为基因组从头测序,就是对某一物种进行全基因组测序,然后进行拼装,从而得到该物种的全基因组序列,为后续功能基因挖掘、调控代谢网络构建、物种进化分析等奠定基础。基于超长读长、无GC偏好性、测序准确性高等特点,PacBio +Hi-C已成为动植物基因组组装的首选技术,组装的Contig N50已达上百M,且已构建了多个物种的基因组完成图。
技术路线:
菲沙优势
稳定的数据产出:PacBio CLR测序平均产出140Gb,最高达到220Gb;CCS测序平均产出达到350Gb,HiFi平均产出达到20Gb,最高达到38Gb。
丰富的项目经验:累计完成近千例基因组de novo项目,涵盖各种动植物样本类型。基于最新的HiFi组装,80%的物种contig N50大于5M,50%的物种contig N50大于10M,最高达到105M。
丰硕的合作成果:基因组项目文章接近100篇,累计影响因子超过600+,包括多篇Cell、Nature、Molecular Plant 、Cell Discovery、PBJ、NC等。
菲沙HiFi组装经验