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各位医生、老师,大家好,今天很荣幸跟大家交流一下高血压疾病研究思路。
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首先来简要介绍一下高血压疾病。
高血压发病是遗传因素和环境因素共同作用的结果。
高血压基因研究成为热点,以往研究提示,高血压有明显的家族聚集性,并有遗传流行病调查数据显示约有60%高血压患者有高血压家族史。
夫妻均患有高血压,其子女发病概率高达46%,因为父母和亲生子女之间存在共同的遗传基础。
高血压分为原发性高血压和继发性高血压。
在临床中,95%的高血压病例病因不详,被称为原发性高血压。它以动脉血压升高,尤其是舒张压持续升高为特点,是常见的心血管疾患之一。原发性高血压是一种遗传因素和环境因素共同作用引起的多基因慢性疾病,原发性高血压的因素很多,大致可以分为遗传和环境因素两个方面。
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第二部分是介绍和高血压相关的基因。
基因是遗传物质的基本单位,在高血压遗传基因中,主要有四类基因影响这高血压的易感程度。
1、血管收缩/舒张通路的调节基因,这类基因调节这血管的正常收缩和舒张,如ACE,AGT等;
2、水盐代谢通路的调节基因,这类基因在调节血液中血钠水平和血容量方面起着重要的作用,如AGT,AGTR1;
3、叶酸代谢通路基因,这类基因参与体内叶酸代谢,该基因编码5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶,是叶酸代谢过程中的关键酶;
4、免疫调控通路基因,这类基因参与免疫反应和炎症反应等。
含有已知突变的基因,这些突变会导致循环系统中的高血压或低血压或心肌病。
与 GWAS 基因座相关的合理基因出现在其可能的表型效应位点附近.
遗传因素会影响血压 (BP) 和 心力衰竭(HF)。
在高血压基因组学中观察到的现象,可以通过引入新技术来代替经典的遗传分析来解决。
GWAS、表观遗传学、药物基因组学和临床特征的准确表型分析(例如,家庭血压测量)是研究成功的关键问题。
此外,新的想法对于寻找阐明高血压发病机制的新方法也至关重要。
人体内部局部的血管收缩及血管平滑肌细胞的增生,促使了高血压的产生和发展,而血管紧张素转换酶(Angiotensin converting enzyme, ACE)在其中起着重要的关键作用,临床上认为人体内血管紧张素转换酶与原发性高血压的发生发展及预后密切相关。
肾素-血管紧张素系统(rein angiotensin system,RAS)的关键酶,同时也是一种激肽酶,通过肾素-血管紧张素系统和激肽释放酶-激肽系统,血管紧张素转换酶可以水解血管紧张素I(Angiotensin converting enzyme, ACE)、产生血管紧张II素(Angiotensin converting enzyme, ACE),这两种作用均有强烈的缩血管收缩升压作用,以维持血压、电解质和体液平衡、血管系统发育和结构重塑。ACE基因位于17号染色体上,ACE基因多态性与多种心血管疾病相关,如高血压、脑血管疾病、冠心病等。
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第三部分是技术手段的介绍。
全基因组重测序(Whole Genome Sequencing,WGS)即对整个基因组进行测序,将测序得到的DNA测序片段和参考基因组进行比对,从而得到其中的变异信息。作为全面分析基因组的方法,WGS的最大特点是包含了非编码区的序列信息。而目前基于WGS技术的疾病研究显示,非编码区的DNA变异与复杂疾病发生有很大关联。如果在基于对疾病病理知识研究不深入情况,比较关注非编码变异和结构变异的研究,WGS是首选的技术。一般测序深度在30X以上,相应的测序数据量在90G以上。WGS的不足在于数据量大,成本高,数据解读难度大,此外测序深度较低,不利于低丰度变异的检测。
全外显子测序(Whole Exome Sequencing,WES)技术只将人类基因组的外显子区域进行测序,人类基因组中包括约180,000个外显子,约占到全部基因组的1.5 %,是人基因组的蛋白编码区域,集中了大部分已知的致病突变位点,是应用频率最高的基因组测序方法之一。WES是利用探针杂交富集外显子区域DNA序列,通过高通量测序,发现与蛋白质功能变异相关遗传突变的技术手段。一般WES测序深度推荐100X以上,相应的数据量是12G 以上。
随着三代测序具有超长读长、无GC偏好,对高度重复等复杂区域也能够准确测序等技术优势,且技术成本持续下降,三代测序技术已为基因行业打开一扇全新的大门。PacBio HiFi Reads兼具了高精度和长读长,持续为三代医学科研保驾护航。
高准确率Q20(>99.9%)、长度长(25kb), 无偏好性的均一覆盖度。
HiFi Reads提供了检测单核苷酸变异体所需的准确性,同时提高了可映射性并运行在没有系统偏好性情况下进行定相。
PacBio HiFi Reads对全变异(SNVs、InDels、SVs)精准检测。
HiFi数据可直接提供5种碱基序列(A,T,G,C,5mC)的数据。
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第四部分是文献案例分享部分,准备了2篇案例分享给大家。
2020年11月23日,英国剑桥大学JoannaM. M. Howson、伦敦玛丽女王大学Patricia B. Munroe等研究人员合作在国际学术期刊《自然—遗传学》上发表了题为 “Discovery of rare variantsassociated with blood pressure regulation through meta-analysis of 1.3 millionindividuals” 的文章。
通过对130万人数据进行荟萃分析,发现与血压调节相关的稀有变异。
新BP相关(a:EAWAS和RV-GWAS中基因组显著性BP相关SNV的富士图,b:维恩图,显示106个新BP基因座在分析BP特征上的重叠,c: VEP对已知和新区域的所有已鉴定的罕见变异体进行功能注释;d:在BP相关SNV的转换上,MAF与效应估计的对比图)
用Mendelian多变量随机研究分析评估BP和中风的因果关系时结果表明,收缩压对所有的脑血管疾病类型的影响最强,对大脑动脉中风影响最为深远,血压对心因性栓塞中风CE的影响最弱,这可能反应心房颤动在CE风险的作用大于血压。
这项研究证明了稀有变异在分析再鉴定基因的作用,其结果突出潜在的治疗靶标。
2022年9月29日,中国医学科学研究院阜外医院陈敬洲与Hao Li在Circulation(IF=40)杂志在线发表题为“Oviductal Glycoprotein 1 Promotes Hypertension by Inducing Vascular Remodeling Through an Interaction With MYH9”的文章。
在这项研究中,研究人员使用illumina 450k BeadChip技术筛选高血压患者,高血压前期个体和健康对照个体的差异基因组DNA甲基化,并通过焦磷酸测序进行验证。此外,采用酶联免疫吸附法测定血浆的输卵管糖蛋白1(oviduct glycoprotein 1, OVGP1)水平,研究发现OVGP1的启动区cg20823859有一个低甲基化位点,并且高血压患者血浆OVGP1水平显著升高,这一发现表明OVGP1与高血压有关。
通过蛋白质和蛋白质相互作用,结果显示,非肌肉的肌球蛋白重链IIA与OVGP1相互作用,而抑制MYH9可减弱OVGP1诱导的高血压和血管重塑。
随着遗传学、基因组学研究,对疾病的更加完整的基因组认识,这可能将为新药研发确定新的靶点,也可能有助于发展疾病的预防策略并且基于疾病的遗传分类可能进行预后预测。