澳门·永利集团3044实验平台位于武汉国家生物产业基地光谷生物城生物创新园,拥有先进的硬件设备,目前已引进PacBio Sequel、PacBio Sequel II、ONT MinION、ONT GridX5、MGISEQ-2000等测序系统,并具有完善健全的规章制度。菲沙实验平台除了建立二代与三代测序的实验流程外,还研发出4C、Hi-C、ChIA-PET、ATAC-Seq、CUT&Tag等三维基因组研究方法,是一个集测序技术服务、三维基因组学技术服务、癌症基因组医学服务、基因检测技术研发等科研服务于一体的高新技术平台。
实验操作流程的规范化、自动化和流程化管理是高通量测序实验数据准确性的保证,永利集团3044实验平台经过长期的项目经验积累和严格的管理,建立了实验室规章制度、人员培训与考核体系、实验标准流程、试剂检验和仪器检定流程,并结合专业的实验室管理系统(LIMS),形成了一套从样品提取检测到上机测序的严格标准操作流程,每个环节层层把控,确保实验质量。
一、样本接收平台
生物样本是科学研究的重要资源,是一切实验的基础,样本质量在很大程度上决定着研究结果的准确性和可靠性,随着基因组学、转录组学以及蛋白质组学等研究手段的飞速进步,各种测序技术对生物样本的质量也提出了更高的要求。因此用于研究的实验样本在采集、贮存、运输和制备的过程中尽可能地做到迅速,最大限度的缩短从样本采集到实验的时间。菲沙样本接收平台配备全套的样本保存设备,由专业人员完成样本的接收与储存,在最大程度上确保样本质量。
二、提取检测平台
生物样本的质量鉴定目前尚未有统一标准,但其提取产物DNA、RNA、蛋白质等生物大分子的质量控制已较为成熟。在分子生物领域中,样本的核酸提取、检测和定量已是每个实验室的的常规实验技术。随着第二代与第三代测序技术的诞生与发展,新的测序技术对核酸提取的总量需求与质量要求大大增加,所以核酸提取的质量控制也比以前更受注重。准确的核酸定量对于这些新的测序技术起了成败的关键作用。因此,现今的核酸提取、检测和定量技术都跟以往有着重大的改变。菲沙在样本处理与检测方面引入了组织破碎仪、Nanodrop 2000C超微量分光光度计、Qubit 3.0核酸定量仪、Agilent 2100生物分析仪与Agilent Femto Pulse脉冲场电泳检测等先进仪器设备,为样本QC提供科学严谨的质量基础。
三、文库构建平台
文库构建是测序的基础,一般的二代建库流程包括基因组DNA的打断、末端修复、连接接头与PCR扩增等标准流程,由于存在PCR扩增的放大与测序读长的限制,二代文库一般只有几百个bp长度,对样本总量与质量要求也相对较低。与二代测序相比,基于单分子测序技术的三代测序具有读长长、测序覆盖度均一、无PCR扩增,无GC偏好性等优势,文库长达几十kb长度,对样本质量要求与建库流程要求更加严格,菲沙引入了大片段文库筛选设备BluePippin与大片段检测设备Femto Pulse,可以实现长达200kb片段大小的检测与质控。
四、上机测序平台
作为国内首家PacBio测序官方认证服务商,菲沙目前已引进PacBio Sequel、PacBio Sequel II、ONT MinION、ONT GridX5、MGISEQ-2000等测序系统,为广大科研工作者提供二代测序、三代测序等科研技术服务。菲沙将依托自身的行业、人才、技术、管理等优势资源,继续进行高通量测序技术及产品研发。
MGISEQ-2000测序仪
Sequel II测序仪
sequel测序仪
ONT GridX5测序仪 ONT MinION测序仪
五、 三维基因组平台
菲沙实验平台除了建立了二代与三代测序的实验流程外,还研发出3C、4C、Hi-C、ChIA-PET、ATAC-Seq与CUT&Tag等三维基因组实验方法。三维基因组以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,可以解析细胞核中染色体三维结构,将有助于科学工作者更深入的了解DNA的空间折叠基础与调控表达机理。