1、分组主成分分析
在做差异分析前，首先对进行差异比较的分组样品进行主成分分析，观察差异分组之间和组内样品之间的变异度大小。
2、正交偏最小二乘法判别分析（OPLS-DA）
PCA分析对相关性较小的变量不敏感，而偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）可以解决此问题。通过OPLS-DA模型分析代谢组数据，绘制各分组的得分图，进一步展示分组之间的差异。
3、代谢物含量差异动态分布
为了更清楚、直观的展示总体代谢差异情况，对比较组中代谢物进行差异倍数值计算，计算之后根据FC值大小进行从小到大的排列，绘制代谢物含量动态分布图。
4、差异代谢物筛选
所检测到的代谢物进行定性和定量分析之后，结合具体样品的分组情况，比较在各分组中代谢物定量信息发生的差异倍数变化。根据FC和OPLS-DA模型的VIP值进行差异统计。
5、差异代谢物富集分析
差异代谢在生物体内相互作用，形成不同的通路。利用KEGG数据库对差异代谢物进行注释并展示。
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