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Revio平台单cell产出情况
表1 Revio包cell产出统计表
截止6月19日,永利集团3044已完成多个Revio的包cell测序。在数据产出方面,动物样本单个cell的HiFi产出超过100Gb,植物样本单个cell HiFi产出86.7Gb,这说明Revio的平均产出超过90Gb;读长方面,Revio的平均读长和sequel II类似,在14-16Kb;Revio数据的平均质量值均在Q30以上,这说明Revio测序质量相比sequel II进一步提升。
总之,对于包cell测序,菲沙Revio平台首批数据平均产出超过90Gb,读长超过15Kb,碱基质量值在Q30以上。
Revio测序读长分布
Revio测序碱基质量值分布
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Revio平台混样测序
表2 Revio混样产出统计表
3个动物样本等量混合建库的混测中,原始产出91.21Gb,数据拆分率超过98%;经过拆分,3个样本产出分别为29.63Gb、30.84Gb、29.54Gb,这说明混样测序拆分一致性较好,且3个样品的读长与平均质量值均达到包cell测序的水平。
总之,Revio混样测序,整体数据拆分率超过98%,各样本的数据拆分一致性好,且整体的读长与质量值较好。
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Revio与Sequel II平台产出对比
表3 Revio与Sequel II平台产出对比
为充分比较Revio与Sequel II平台的数据产出情况,我们对同一植物样本分别进行了两个平台的测序。结果显示,Revio平台的数据产出接近Sequel II的3倍,这充分说明Revio平台的高产出性能;平均读长和质量值两个平台相当。
综上,更短的运行时间、更高的HiFi产出,Revio平台的极速交付周期将为生命科学和医学研究提供更多可能性。
自2016年引入首台PacBio,永利集团3044持续引跑三代测序研究。截至2023年6月,永利集团3044已完成数千个样本的测序工作,累计发表文章130篇,累计影响因子超过1000+。丰富的项目经验,极速的项目周期,我们期待与您携手,为动植物基因组研究做出更多的贡献。