近年来，随着多种植物参考基因组的不断公布及同种不同个体基因组间的相互比较，人们逐渐认识到单一参考基因组不能涵盖物种所有的遗传信息。于是，泛基因组应运而生。泛基因组由Tettelin等人于2005年在细菌中提出，指一个生物分支(如一个物种)的全部基因组信息，包括核心基因组和非必须基因组。随着基因组测序和分析技术的不断发展，泛基因组逐渐成为新的研究热点，并已在植物、动物中广泛研究，为全面解析物种或类群水平的遗传变异和多样性、功能基因组和系统进化重建等研究提供强有力的工具。
2023年10月2日，华中农业大学园艺林学学院、果蔬园艺种质创新与利用全国重点实验室邓秀新院士/徐强教授团队在国际知名期刊《Nature Genetics》上发表题为“Pangenome analysis provides insight into the evolution of the orange subfamily and a key gene for citric acid accumulation in citrus fruits”的研究论文。该研究在全球范围内收集了312份柑橘亚科种质资源的全基因组数据，构建柑橘亚科的系统进化树，揭示了柑橘属和柑橘亚科的起源和演化历程。同时对12个柑橘亚科物种的基因组进行了从头组装，并结合已发表的6个柑橘属基因组，绘制了柑橘亚科的泛基因组图谱。利用柑橘亚科的泛基因组图谱并结合转录组分析，鉴定到调控柑橘果实柠檬酸积累的关键转录因子CitPH4，该转录因子通过结合并激活液泡膜质子泵基因PH5调控柑橘液泡酸化进而促进柠檬酸积累。本研究为柑橘亚科的起源和进化以及水果风味进化的调控机制提供了见解。
永利集团3044“智周万物”论坛，特邀该论文共同第一作者、华中农业大学园艺林学学院博士后黄跃对“基于基因组解析柑橘的起源和进化”主题内容作在线报告，欢迎各位感兴趣的老师届时参与和讨论。
报告时间
2023年10月19日14:00-15:00
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