近日,华中科技大学同济医学院附属同济医院刘继红教授团队在国际知名内分泌学研究杂志Journal of Endocrinological Investigation上发表了题为“Cell adhesion molecule L1 like plays a role in the pathogenesis of idiopathic hypogonadotropic hypogonadism ”的研究成果。该研究采用WES测序成功鉴定出特发性低促性腺激素性性腺功能减退的致病突变:CHL1 基因c.1550G > A(p.G517E),随后通过体外功能实验进一步验证了CHL1 基因c.1550G > A(p.G517E)变异的致病性。永利集团3044参与了该项目全外显子组测序和生物信息分析工作。
研究背景
人的青春期发育受下丘脑-垂体-性腺(HPG)轴的调节。特发性低促性腺激素性性腺功能减退(IHH)是一种由HPG轴功能障碍引起的罕见疾病,其特征是青春期发育缺失或发育不全和不孕症。研究发现与IHH疾病相关基因发生缺陷会导致GnRH神经元迁移缺陷,嗅觉轴突导向缺陷,神经内分泌缺陷和性腺激素分泌异常。细胞粘附样分子L1 (cell adhesion molecule L1 like, CHL1)是神经细胞粘附分子家族的另一成员。CHL1主要表达于神经系统,并在神经元的定位和迁移、轴突的生长和树突的导向过程中发挥重要作用。然而,很少有研究报道CHL1在GnRH神经元与IHH中的作用。
研究方法
研究人员对先证者( FII-2)、母亲(FI-2)和弟弟(FII-3)进行了全外显测序,并对可疑致病变异及其共分离情况进行Sanger测序验证,采用未成熟的GnRH神经元细胞系(GN11细胞)在体外研究CHL1 基因c.1550G > A(p.G517E)变异对细胞功能的影响,验证其致病性。
研究结果
IHH家系中CHL1的突变谱
该家系中共鉴定出4个CHL1、TAOK2、LAMA1和AXL基因罕见测序变异(表1),其中CHL1、TAOK2和LAMA1基因被报道与神经发育和轴突引导有关,而AXL是已知的IHH致病基因。在先证者(HH, FII-2)、患病的弟弟(IHH, FII-5)和他们的母亲(嗅觉缺失,FI-2)均检出CHL1 RSV(c.1550G>A, p.G517E) 。先证者及母亲均检出TAOK2和AXL RSVs。在先证者、患病的弟弟和他们的父亲(未患病,FI-1)中均检测出LAMA1 RSV。因此,先证者与患病的弟弟相比,从母亲那里额外遗传了两个RSV (TAOK2和AXL RSV)。该IHH家系基因突变分析和Sanger测序见图1。
表1罕见测序变异在在线评分数据库中的预测结果
图1 IHH家系基因突变分析和Sanger测序
CHL1 RSV的致病性分析
SIFT, Polyphen2, PROVEN和 Mutation Taste四个预测软件预测 CHL1 RSV为可能致病 (PP)或致病 (P),而其他基因的RSV只有其中一个预测软件预测为可能致病 (PP)或致病 (P),提示CHL1 RSV可能影响CHL1蛋白的功能。CHL1蛋白是一种膜蛋白,包含6个免疫球蛋白(Ig)样C2结构域和4个纤黏连蛋白III结构域。p.G517残基位于第5个免疫球蛋白(Ig)样C2结构域 (图2a)。晶体结构预测,原始氨基酸甘氨酸是β-链结构的一部分,而替代氨基酸谷氨酸是不规则卷曲的一部分(图 2b)。甘氨酸被谷氨酸取代后,其电荷由中性变为酸性,表明这可能会影响相关残基的相互作用,进而影响蛋白质折叠。保守分析表明p.G517残基在其他7种脊椎动物中有高度的同源性(图2c),表明该位点在自然界中相对保守。
图2 CHL1 RSV的蛋白结构、晶体结构预测及保守性分析
CHL1 RSV体外功能试验分析
体外功能试验表明:1.CHL1 RSV不影响CHL1的表达及亚细胞定位(图2d-h);2. CHL1敲除和CHL1 RSV可能通过影响ERK1/2的激活水平而抑制GN11细胞迁移(图3a-f);3.CHL1可能通过改变钙负荷水平和RIPK3 、MLKL的转录水平来调控 GN11细胞的死亡,CHL1 RSV则会影响此调控过程(图4a-i)。
图3 CHL1对GN11细胞迁移的影响
图4 转录组分析及CHL1对GN11细胞坏死的影响
研究结论
本研究在一个IHH家系中发现了一个CHL1罕见测序变异(c.1550G>A, p.G517E),扩展了IHH疾病的遗传图谱。体外功能试验分析表明CHL1可能通过改变ERK1/2的激活状态、钙负荷水平以及RIPK3和MLKL转录水平来调控GN11细胞的迁移和坏死,而CHL1 RSV(c.1550G>A, p.G517E)使CHL1蛋白功能受损,进而抑制GN11细胞的迁移和坏死,导致IHH疾病的发生。