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近年来，染色质的三维空间构象在转录调控中的作用受到越来越多的关注。然而，Hi-C技术需要的测序量庞大，SS Rao et al [Cell](2014)在GM12878细胞系中测定了4.9 billion的contacts，从而达到了1k的分辨率，同时在IMR90、 HMEC、 NHEK、 K562、HUVEC、HeLa、 KBM7与小鼠CH12-LX的细胞系中测得了395 M 到1.1 billion的contacts，进而达到了5kb的分辨率。如此庞大的测序量需求，阻碍了更加精细地解析基因的转录调控关系。幸而近年，学者们研发的Promoter Capture Hi-C技术能更好的适用于精细的基因转录调控，也即基因的promoter区域可能受哪些顺式调控元件的调控。

Promoter Capture Hi-C技术流程

Promoter Capture Hi-C技术，是在复杂Hi-C文库的基础上增加了一个捕获启动子区的步骤，用于靶向研究基因组启动子区互作信息。由于是对全基因组启动子区进行富集捕获测序，在获得相同分辨率情况下，Capture Hi-C的测序量和成本降低，并且随着测序深度的增加，启动子区的数据信息会大大增加，便于更深入的分析。与此同时，通过全基因组关联研究（GWAS）结果报告，许多疾病的变异序列有高达95%以上位于基因非编码区，应用Promoter Capture Hi-C研究启动子与GWAS中风险位点的联系便是一大热门，如乳腺癌、结直肠癌和自身免疫病等的多篇相关文章已相继报道。

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