核心基因与非核心基因分析
获得泛基因组大小、获得编码基因的数目、核心基因的数目和比例、非核心基因的数目和比例等，以及进行GO和KEGG的功能注释等。
SV检测及影响分析
统计SV的类型（PAV/倒位、易位、缺失、插入）、SV的长度分布、SV区域重复序列的含量、SV的分布，以及SV对基因结构和功能的影响。
PAV-群体进化/PAV-GWAS分析
PAV-GWAS分析既能与已有的SNP-GWAS结果相互验证，也能发现新的与性状相关的基因，进而可以更好的解释表型的形成机制。
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